疫情一開始時，因為食藥署藥品組會議決議藥用酒精優先供應給醫療院所，導致社區藥局無法取得酒精，所以全聯會才會協助向疫情指揮中心反映，由食藥署出面跟中華郵政、台酒等單位協調爭取，最後再由中華郵政協助配送台酒生產的防疫酒精至社區藥局，以完成此供應鏈。然而，酒精屬於第三類易燃液體危險品，有其相關運輸規範，所以上述供應鏈開始前之第一時間(2/17)，也公告防疫酒精供應之相關流程，也已言明停配模式，以免行政上的困擾。此外，全聯會也每週都會向各縣市公會調查藥局2週後的酒精需求，如果「不需要配送酒精」，在調查該階段即可提出，就不會再配貨。

在這裡先感謝各地方公會之積極與效率，從酒精開始配送至今，陸續已有1000家左右之藥局及早評估自身藥局狀況而提出停配了，全聯會也配合各地方公會名單提供停配藥局名冊給食藥署，也因此食藥署、台酒、中華郵政都沒有所謂的退貨機制。全聯會也在4/15、4/22以及4/29再度提請食藥署放寬藥用酒精之供應範圍，但要反映在實際供貨面上，還需要大家一起努力。
*目前需要請各公會協助的地方是:
提升貴會會員之間酒精之流通調度，同時也請協助宣導並解釋無法退貨的前因後果。*
在這裡也再度提醒，目前藥用酒精仍僅供應給醫療院所，除非有餘裕才能供應給藥局及藥商，藥局可以自行評估進貨狀況及疫情、各國酒精生產狀況，因目前食藥署已經不再協助委請中華郵政運送台酒防疫酒精到社區藥局，未來社區藥局如有需求只能自行至台酒載運，全聯會無物流系統因此無法協助酒精配送。